Doktor Faust quedó incompleto en el momento de la muerte de Busoni. Concebida como su obra maestra, la génesis de la ópera fue compleja y larga. Basada en la trágica obra de Goethe, la historia del pacto de Fausto con el diablo es bien conocida, pero la estructura de la ópera representa la concepción única de Busoni, dividida en dos prólogos, un hermoso intermezzo orquestal y tres escenas. Explorando ideas de racionalidad y duda metafísica, así como los conceptos de artificio y pretensión inherentes a la interpretación operística, el resultado es una de las obras más creativas e inquietantes de Busoni.