Riko y sus amigos deben resolver el trágico misterio de la Villa de las Sombras de la sexta capa de las profundidades si quieren seguir adelante con su aventura. Tras derrotar al Soberano del Amanecer, Riko, Reg y Nanachi descienden finalmente a la sexta capa de las profundidades convirtiendo su aventura en un viaje sin retorno. Allí, para su sorpresa encuentran a antiguos seres humanos transformados por la Maldición del Abismo que habitan con sus propios valores en lo que denominan la Villa de las Sombras. Pero, ¿cuál es el secreto del lugar y sus habitantes? La historia se remonta a 100 años atrás cuando el escuadrón suicida Ganja del que formaba parte Vueko se adentró en el Abismo en busca de la Ciudad Dorada. Pasado y presente se entrelazan en el trágico origen de la villa y de la misteriosa Faputa la Princesa de las Sombras, la personificación del valor que parece tener un pasado en común con el amnésico Reg.
