Rintaro Okabe, el autodenominado científico loco quedescubrió el secreto para viajar en el tiempo, llamóla atención de cierta organización que para amedrentarlo, asesinó a su amigovia Mayri. Para salvar su vida, Okabe deberá viajar una y otra vez en el tiempo hasta evitar esa muerte, aunque para ello tuviera que permitir que otra chica, Makise, muera el mismo día enel que se conocen. Claro que nada es tan simple comoparece, y esta muerte sirve como punto de partida a nada menos que la III Guerra Mundial, y en el medio deuna crisis de identidad, conocerá una inteligencia artificial que encima le reabrirá viejas heridas.